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Boc-D-Leu-OH·H₂O (N-Boc-D-leucina monohidrato, CAS 16937-99-8) es la forma cristalina monohidratada y protegida con N-Boc del enantiómero D no natural del aminoácido esencial leucina. La molécula presenta un grupo protector terc-butiloxicarbonilo (Boc) unido al grupo α-amino de la D-leucina, salvaguardando la amina durante la síntesis de péptidos y preservando al mismo tiempo el ácido carboxílico libre para las reacciones de acoplamiento.

El acetato de boc-metioninatiol (CAS 139429-04-2) es un derivado de aminoácido especializado protegido con Boc que presenta una funcionalidad tioacetato. La molécula incorpora un grupo protector terc-butiloxicarbonilo (Boc) en el resto amino, combinado con una estructura de tiol derivada de metionina que ha sido acetilada para formar el derivado tioacetato (S-acetilo).

Boc-Ala-OH (N-(terc-butoxicarbonil)-L-alanina) es un derivado de aminoácido protegido con Boc que presenta un grupo protector terc-butiloxicarbonilo (Boc) unido al grupo α-amino de la L-alanina. La molécula consta de un carbono quiral central que lleva un grupo amino (protegido como carbamato), un ácido carboxílico y una cadena lateral metilo, el andamio de aminoácidos quirales más simple.

Boc-pGlu-OEt (éster etílico del ácido N-Boc-L-piroglutámico, también conocido como Boc-Pyr-OEt o (S)-1-Boc-5-oxopirrolidina-2-carboxilato de etilo) es un derivado protegido del ácido L-piroglutámico. La molécula presenta un núcleo de ácido piroglutámico, un aminoácido cíclico formado por ciclación intramolecular del ácido glutámico, con un grupo terc-butiloxicarbonilo (Boc) que protege el nitrógeno del anillo y un éster etílico que protege el ácido carboxílico.

Z-Trp(Boc)-OH.DCHA (sal de Nα-Z-Nᶦⁿ-Boc-L-triptófano diciclohexilamonio) es un derivado de L-triptófano doblemente protegido que presenta dos grupos protectores ortogonales. La molécula consta de un núcleo de L-triptófano con un grupo carbobenzoxi (Z) que protege la funcionalidad α-amino y un grupo terc-butiloxicarbonilo (Boc) que protege el nitrógeno de la cadena lateral del indol.

Boc-D-Phe-OH (N-α-terc-Butoxicarbonil-D-fenilalanina) es un derivado de D-fenilalanina protegido que presenta un grupo terc-butiloxicarbonilo (Boc) unido a la funcionalidad α-amino. La molécula consta de un núcleo de fenilalanina de configuración D, un aminoácido quiral con una cadena lateral de bencilo, con el grupo protector Boc protegiendo al grupo amino de reacciones secundarias no deseadas.