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Boc-D-Val-OH (N-Boc-D-valina, CAS 22838-58-0) es un derivado de aminoácido protegido que presenta un grupo terc-butoxicarbonilo (Boc) que protege la funcionalidad α-amino de la D-valina. Como enantiómero D de la valina, Boc-D-Val-OH representa la estereoquímica opuesta en el carbono α en comparación con la L-valina natural, con una rotación específica de [α]²⁰/D +5,0 a +8,0° (c=1, ácido acético).

Boc-D-Pro-OH (N-Boc-D-prolina, CAS 37784-17-1) es un derivado de aminoácido protegido que presenta un grupo terc-butoxicarbonilo (Boc) que protege la amina secundaria de D-prolina. Como aminoácido secundario cíclico, Boc-D-Pro-OH presenta características estructurales únicas que lo distinguen de los α-aminoácidos estándar: el anillo de pirrolidina impone importantes limitaciones conformacionales en las cadenas principales de péptidos, mientras que la configuración D proporciona la estereoquímica no natural que se valora cada vez más en el diseño de fármacos peptídicos.

Boc-Gln-OH (Nα-Boc-L-glutamina, CAS 13726-85-7) es un derivado protegido del aminoácido L-glutamina, que presenta un grupo terc-butoxicarbonilo (Boc) que protege la funcionalidad α-amino. La fórmula molecular es C₁₀H₁₈N₂O₅ con un peso molecular de 246,26 g/mol. La molécula retiene la cadena lateral carboxamida de la glutamina, que es crucial para los enlaces de hidrógeno y el reconocimiento biológico.

Boc-Tyr-OH (N-Boc-L-tirosina, CAS 3978-80-1) es un derivado protegido del aminoácido esencial L-tirosina, que presenta un grupo terc-butoxicarbonilo (Boc) que protege la funcionalidad α-amino. La fórmula molecular es C₁₄H₁₉NO₅ con un peso molecular de 281,31 g/mol.

Boc-Glu(OMe)-OH (éster 5-metílico del ácido N-Boc-L-glutámico, CAS 45214-91-3) es un derivado protegido del ácido L-glutámico que presenta un grupo terc-butoxicarbonilo (Boc) que protege la funcionalidad α-amino y un éster metílico que protege la cadena lateral del ácido γ-carboxílico. La fórmula molecular es C₁₁H₁₉NO₆ con un peso molecular de 261,27 g/mol. Esta estrategia de protección ortogonal, que emplea un grupo Boc lábil a los ácidos para la amina y un éster metílico lábil a las bases para el carboxilato de cadena lateral, permite reacciones selectivas de desprotección y acoplamiento durante la síntesis de péptidos en fase sólida y en fase de solución.

Boc-His(Tos)-OH (Nα-Boc-N(im)-tosil-L-histidina, CAS 35899-43-5) es un derivado doblemente protegido del aminoácido L-histidina, que presenta un grupo protector Boc (terc-butoxicarbonilo) en el grupo α-amino y un grupo protector tosilo (p-toluenosulfonilo) en la cadena lateral de imidazol.