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El producto Fmoc-N-Metil-L-Val-OH (IUPAC: N-[(9H-fluoren-9-ilmetoxi)carbonil]-N-metil-L-valina, también conocido como Fmoc-N-Me-Val-OH) es un derivado especializado protegido con N-α-Fmoc de N-metil-L-valina. La molécula está construida sobre la cadena lateral alifática ramificada de la valina, pero la modificación estructural definitoria es la sustitución del hidrógeno de la amida principal por un grupo metilo en el átomo de nitrógeno.

Fmoc-AzaTrp-OH (Fmoc-L-7-azatriptófano, también conocido como ácido (S)-2-((((9H-fluoren-9-il)metoxi)carbonil)amino)-3-(1H-pirrolo[2,3-b]piridin-3-il)propanoico) es un componente básico de aminoácido especializado protegido por Fmoc que incorpora un sistema de anillo aza-indol en lugar del cadena lateral de indol estándar del triptófano. El grupo protector Fmoc en el extremo N permite una integración perfecta en los flujos de trabajo estándar de Fmoc SPPS, mientras que la fracción 7-azatriptófano introduce un átomo de nitrógeno en el anillo de indol que altera significativamente las propiedades electrónicas y de enlace de hidrógeno de la cadena lateral.

Boc-Pip(Fmoc)-OH (ácido 4-(Boc-amino)-1-Fmoc-piperidina-4-carboxílico, CAS 368866-07-3) es un derivado de aminoácido no natural conformacionalmente restringido construido sobre un sistema de anillos de piperidina. La molécula presenta un núcleo de ácido piperidina-4-carboxílico con dos grupos protectores ortogonales: un grupo terc-butoxicarbonilo (Boc) que protege el nitrógeno 4-amino y un grupo 9-fluorenilmetoxicarbonilo (Fmoc) que protege el nitrógeno del anillo en la posición 1.

Fmoc-Sar-OH.H2O es la forma de sarcosina (N-metilglicina) protegida con Fmoc, suministrada como forma cristalina monohidrato. La sarcosina es el aminoácido N-alquilado más simple y presenta un grupo amino secundario (—NH—) en lugar del grupo amino primario que se encuentra en los α-aminoácidos estándar. Esta diferencia estructural altera fundamentalmente el comportamiento conformacional de los péptidos que contienen sarcosina: el grupo N-metilo restringe la flexibilidad de la columna vertebral, reduce la propensión a formar enlaces de hidrógeno e imparte preferencias de estructura secundaria únicas a las que no se puede acceder con los residuos de aminoácidos convencionales.

Fmoc-N-Me-Trp(Boc)-OH (N-α-(9-Fluorenilmetoxicarbonil)-N-α-metil-N-in-terc-butoxicarbonil-L-triptófano, CAS 197632-75-0) es un derivado de triptófano N-metilado diprotegido diseñado para la síntesis de péptidos en fase sólida (SPPS) basada en Fmoc. La molécula incorpora tres características estructurales clave: un grupo Fmoc que protege la función α-amino, un grupo N-metilo en el nitrógeno α y un grupo Boc que protege el nitrógeno indol de la cadena lateral del triptófano.

Fmoc-Asp(OMpe)-OH (éster β-3-metilpent-3-ílico del ácido N-α-Fmoc-L-aspártico) es un derivado del ácido L-aspártico protegido con Fmoc que lleva el grupo protector de cadena lateral estéricamente exigente β-3-metilpent-3-ilo (OMpe). El compuesto se desarrolló específicamente como una alternativa avanzada al Fmoc-Asp(OtBu)-OH estándar para su uso en la síntesis de péptidos en fase sólida (SPPS) de Fmoc, donde el tratamiento repetitivo con piperidina durante la desprotección de Fmoc puede desencadenar una formación extensa de subproductos relacionados con la aspartimida en los residuos de aspartilo, particularmente en las secuencias Asp-Gly, Asp-Ser y Asp-Thr.