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Boc-D-Phe-OH (N-α-terc-Butoxicarbonil-D-fenilalanina) es un derivado de D-fenilalanina protegido que presenta un grupo terc-butiloxicarbonilo (Boc) unido a la funcionalidad α-amino. La molécula consta de un núcleo de fenilalanina de configuración D, un aminoácido quiral con una cadena lateral de bencilo, con el grupo protector Boc protegiendo al grupo amino de reacciones secundarias no deseadas.

GS-650804 / Boc-(S)-ciclopropilglicina (ácido N-[(1,1-dimetiletoxi)carbonil]-(S)-amino-ciclopropilacético) es un aminoácido no natural protegido por Boc que presenta un grupo ciclopropilo en el carbono α del armazón de glicina. Este motivo estructural único combina el anillo de ciclopropilo estéricamente restringido con la quiralidad de la configuración (S), creando un análogo de aminoácido conformacionalmente bloqueado que es muy valorado en la química medicinal y la investigación de péptidos.

Boc-His(Trt)-Ala-OH (N-[(1,1-dimetiletoxi)carbonil]-1-(trifenilmetil)-L-histidil-L-alanina) es un bloque de construcción de dipéptido protegido que presenta un residuo de histidina protegido por Boc en el extremo N con un grupo tritilo (Trt) en la cadena lateral de imidazol, acoplado a un residuo de alanina en el extremo C.

Pal-Lys(Boc)-OH (éster de palmitoilo de N-[(1,1-dimetiletoxi)carbonil]-L-lisina) es un derivado de aminoácido especializado que presenta una estructura principal de lisina con modificaciones duales: un grupo protector de terc-butiloxicarbonilo (Boc) en la funcionalidad α-amino y un grupo éster de palmitoilo (hexadecanoilo) en la cadena lateral carboxilo.

H-D-Lys(Boc)-NH2 (N⁶-(terc-Butoxicarbonil)-D-lisina amida) es un derivado de D-lisina de un solo enantiómero, protegido ortogonalmente. Con la fórmula molecular C₁₁H₂₃N₃O₃ y un peso molecular de 245,32 g/mol, este compuesto presenta una arquitectura molecular que consiste en un grupo α-amino libre, una carboxamida C-terminal y una cadena lateral ε-amino protegida con terc-butoxicarbonilo (Boc).

Boc-Pip-OtBu (4-{[(terc-butoxi)carbonil]amino}piperidin-4-carboxilato de terc-butilo) es un derivado de piperidina protegido que presenta grupos protectores duales de terc-butilo. Con la fórmula molecular C₁₅H₂₈N₂O₄ y un peso molecular de 300,39 g/mol, este compuesto presenta un anillo de piperidina con las funcionalidades amina y carboxilo protegidas como carbamatos de terc-butilo y ésteres de terc-butilo, respectivamente.