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Boc-Asn-OH (Nα-(terc-Butoxicarbonil)-L-asparagina, CAS 7536-55-2) es un derivado protegido por Boc del aminoácido natural L-asparagina. La molécula presenta un grupo protector terc-butiloxicarbonilo (Boc) unido al grupo α-amino, salvaguardando la funcionalidad de la amina durante la síntesis de péptidos y dejando el grupo carboxilo y la carboxamida de cadena lateral disponibles para transformaciones selectivas.

Boc-D-Leu-OH·H₂O (N-Boc-D-leucina monohidrato, CAS 16937-99-8) es la forma cristalina monohidratada y protegida con N-Boc del enantiómero D no natural del aminoácido esencial leucina. La molécula presenta un grupo protector terc-butiloxicarbonilo (Boc) unido al grupo α-amino de la D-leucina, salvaguardando la amina durante la síntesis de péptidos y preservando al mismo tiempo el ácido carboxílico libre para las reacciones de acoplamiento.

El acetato de boc-metioninatiol (CAS 139429-04-2) es un derivado de aminoácido especializado protegido con Boc que presenta una funcionalidad tioacetato. La molécula incorpora un grupo protector terc-butiloxicarbonilo (Boc) en el resto amino, combinado con una estructura de tiol derivada de metionina que ha sido acetilada para formar el derivado tioacetato (S-acetilo).

Boc-Ala-OH (N-(terc-butoxicarbonil)-L-alanina) es un derivado de aminoácido protegido con Boc que presenta un grupo protector terc-butiloxicarbonilo (Boc) unido al grupo α-amino de la L-alanina. La molécula consta de un carbono quiral central que lleva un grupo amino (protegido como carbamato), un ácido carboxílico y una cadena lateral metilo, el andamio de aminoácidos quirales más simple.

Boc-pGlu-OEt (éster etílico del ácido N-Boc-L-piroglutámico, también conocido como Boc-Pyr-OEt o (S)-1-Boc-5-oxopirrolidina-2-carboxilato de etilo) es un derivado protegido del ácido L-piroglutámico. La molécula presenta un núcleo de ácido piroglutámico, un aminoácido cíclico formado por ciclación intramolecular del ácido glutámico, con un grupo terc-butiloxicarbonilo (Boc) que protege el nitrógeno del anillo y un éster etílico que protege el ácido carboxílico.

Z-Trp(Boc)-OH.DCHA (sal de Nα-Z-Nᶦⁿ-Boc-L-triptófano diciclohexilamonio) es un derivado de L-triptófano doblemente protegido que presenta dos grupos protectores ortogonales. La molécula consta de un núcleo de L-triptófano con un grupo carbobenzoxi (Z) que protege la funcionalidad α-amino y un grupo terc-butiloxicarbonilo (Boc) que protege el nitrógeno de la cadena lateral del indol.