Fosforamidita 2'-F-dU

La fosforamidita 2'-F-dU incorpora 2′-fluoro-2′-desoxiuridina en oligonucleótidos sintéticos. La modificación 2′-fluoro aumenta drásticamente la estabilidad térmica de los dúplex formados con ARN complementario (ΔTm ≈ +2–3 °C por modificación) en comparación con el ADN o incluso el 2′-O-metil ARN, al tiempo que confiere una resistencia excepcional a la degradación de las nucleasas. La fosforamidita 2'-F-dU es particularmente valiosa en el diseño de ARNip, donde las modificaciones 2′-F en la cadena sentido pueden reducir los efectos fuera del objetivo y mejorar la estabilidad metabólica sin comprometer la actividad del ARNi. La fosforamidita 2'-F-dU también se utiliza en el desarrollo de aptámeros, ya que la modificación 2′-F amplía la diversidad química de las bibliotecas de aptámeros y mejora la vida media in vivo. La base de uridina no requiere un grupo protector de amina exocíclica (a diferencia de C, A o G), lo que hace que la fosforamidita 2'-F-dU sea más sencilla de desproteger: el tratamiento con amoníaco concentrado estándar o AMA elimina el grupo cianoetilo y escinde el oligonucleótido del soporte, sin pasos adicionales para la desprotección de la base. La fosforamidita 2'-F-dU es totalmente compatible con los sintetizadores estándar de ADN/ARN, aunque es posible que sea necesario ampliar los tiempos de acoplamiento (de 6 a 10 minutos) debido al efecto aceptor de electrones del átomo de flúor.

Parámetros del producto

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Ruta Sintética

Bajo protección con argón, se disolvió 5'-O-(4,4'-dimetoxitrifenilmetil)-2'-desoxi-2'-fluorouridina (3,00 g, 5,47 mmol) en diclorometano anhidro (50 ml). Se añadieron secuencialmente N,N-diisopropiletilamina (0,55 ml, 3,18 mmol), 1H-tetrazol (0,45 g, 6,45 mmol) y bis(2-cianetilamino)(2-cianoetoxi)fosfina (1,92 g, 6,36 mmol). La mezcla de reacción se agitó durante la noche a temperatura ambiente. Tras la confirmación de la finalización mediante TLC, se añadió una solución acuosa de bicarbonato de sodio al 5 % (20 ml) para separar las capas; la capa orgánica se lavó con solución salina saturada (20 ml). Después de secar con sulfato de sodio anhidro, la capa orgánica se concentró a presión reducida. El producto bruto se purificó mediante cromatografía en columna de gel de sílice usando una mezcla de hexano/acetato de etilo que contenía 3% de trietilamina (de 75:25 a 30:70, v/v). La fracción que contenía el producto objetivo se recogió y se concentró a presión reducida, produciendo (2R,3R,4R,5R)-2-(bis(4-metoxifenil)(fenil)metoxi)metil)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihidropirimidin-1(2H)-il)-4-fluoro-4-hidroxitetrahidrofuran-3-il(2-cianetil)disoisoprofosfamida (2,76 g, rendimiento 67,3%).

Garantía de calidad en Cosperpharm

Cada lote se somete a:

● Cromatografía de gases (GC): pureza ≥97,0%

● Valoración no acuosa: pureza ≥97,0%

● Índice de refracción – análisis confirmatorio

● ¹H NMR – verificación estructural

● Apariencia: líquido transparente de incoloro a amarillo claro a naranja claro

Cada envío viene acompañado de un COA completo, una MSDS (con información completa del GHS) y un certificado de origen.

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